ubuntu上编译LAMMPS

ubuntu上编译LAMMPS
需要在系统上预先装有mpich和fftw的开发库，而且fftw还要求不是最新的3.x版，而是2.x。
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代码:
apt-get install fftw2 libmpich1.0-dev gfortran
下载并解压缩源文件包以后，进入解压后路径下的src/目录，只要简单的“make debian”就可以得到可执行文件(lmp_debian)

得到lmp_debian之后，就可以运行那些例子了。但是你并没有得到lammps所支持的所有功能。lammps支持package，有系统自带的也有用户自行开发的。默认只编译"kspace", "manybody", 和"molecule"三个系统自带的包。其他还有一些“ asphere class2 colloid dipole dpd granular meam opt poems xtc”包没有编译进可执行程序，也就是说你不能使用那些额外功能。 如果需要全部编译。这可以通过先“make yes-all”然后“make clean”,"make debian"来完成。

稍微有一点麻烦的是，有两个包“meam”和“poems”是第三方开发的独立程序，源代码并没有在src目录下。你需要到../lib/中才可以看见它们的目录，需要分别编译。

先说poems，应该用用于刚体模拟的，进入lib/poems/后，直接“make Makefile.g++”
再说编译meam，这个meam是fortran写的，前面由于已经安装了gfortran，作者也给了Makefile.gfortran,所以只要“make Makefile.gfortran”即可得到libmeam.a了

到这里，我们准备好了所有的lammps附属包，可以重新编译最终的可执行文件了。为了能让编译器找到需要库和头文件，我们还需手工修改一下makefile。我这里就是修改src/MAKE/Makefile.debian。要改这三行：
CCFLAGS = -g -O -I/usr/lib/mpich/include/ -DFFT_FFTW -DLAMMPS_GZIP -I/lammps全路径/lib/poems/ -I/lammps全路径/lib/meam/
LINKFLAGS = -g -O -L/lammps全路径/lib/poems/ -L/lammps路径/lib/meam/
USRLIB = -lfftw -lmpich -lpoems -lmeam -lgfortran -lgfortranbegin
注意加粗的地方是要添加的。大致的意思就是告诉编译器哪里有额外的库文件，头文件。

欢迎大家拍砖。

其实，安装了下面这个东西（因为lammps需要老版本的fftw），才能真正编译通过。
┌─────┐
│fftw安装 │
└─────┘
fftw-2.1.5.tar.gz
./configure --prefix=/usr/local/fftw CC=icc CFLAGS=-O2
make
make install
注：笔者水平有限，安装较新的fftw-3.x的版本，只能得到fftw3.h，但lammps源代码中却需要fftw.h的头文件，试了重安fftw-3.x好几次，吾欲fftw.h而不可得，只好退回2.1.5。